У ваздуху, на копну и у води
За разлику од бујне флоре, фауна Мадеире је прилично неупадљива. На острвима у природи готово да није било копнених сисара, осим слепих мишева. Кућни љубимци и зечеви су дошли овде захваљујући људима. Потоњи су популарна ловачка игра.
У водама острва живе разне врсте китова, које су постале ретке, и медвједице, које су сада под строгом заштитом. Према последњем пребројавању, на острвима Десертас је још увек било 16 животиња.
Птичији свет је бројнији: овде се гнезди око 40 врста птица, а многе их редовно посећују острва. Планински миш је једна од најчешћих птица грабљивица. Ендемски голуб Мадеира, нажалост, десеткован је ловом.
Врло често се још увек може видети Мадеиран голдцрест, који живи углавном у области ловорових шума и у грмљу вријеска. Сродник нашег популарног канаринца је канаринац, који живи у топлијим крајевима у близини обале. Морске птице су такође овде као код куће: на пример, Мадеиран пескарица и црна Булверова буревица.
За планинаре је свакако охрабрујуће сазнање да нема змија. Овде живе само мали гуштери попут зидног гуштера Мадеира и зидног гекона.
На Мадеири живи око 2.600 различитих врста инсеката, од којих су многе ендемске. Посебност је монарх који се издваја по наранџасто-браон боји и распону крила до 14 цм.
Многе врсте риба живе у водама око Мадеире. У халама рибарнице можете се дивити око 100 јестивих сорти. То укључује туњевину и дубокоморске рибе, као што је црна морска риба, која живи на дубини од око 600 до 1.400 м.